| 講演抄録／キーワード |
| 講演名 |
2004-09-14 11:15
ガウス型目的関数を用いた最適化による分子構造の推定
○臼居亮二・土居伸二・熊谷貞俊（阪大） |
| 抄録 |
（和） |
タンパク質の3次元立体構造を決定することは，生命現象の解明，医薬品の開発等において重要である．タンパク質の構造は，主にNMR解析やX線結晶解析により解析される．NMR解析では，タンパク質を構成する原子間の距離データが得られる．原子間距離データから原子の座標を決定する問題は，Distance geometry problemと呼ばれる．本研究では，ガウス型目的関数を提案し，その目的関数の最適化問題を解くことによりタンパク質の立体構造決定を行う． |
| （英） |
It is important to determine a three-dimensional protein structure in the elucidation of biological phenomena, the development of drug medicines, etc. The conformations of proteins are mainly analyzed by the NMR (Nuclear Magnetic Resonance) spectroscopy and the X-ray crystallography. In the NMR spectroscopy, distance data among some atoms are approximately given, and a protein structure is determined by solving the so-called distance geometry problem. In this research, we propose a gaussian objective function and determine the protein conformation by solving the global optimization problem of the objective function. |
| キーワード |
（和） |
タンパク質 / 立体構造 / distance geometry problem / ガウス型目的関数 / 大域的最適化 / / / |
| （英） |
protein / conformation / distance geometry problem / gaussian objective function / global optimization / / / |
| 文献情報 |
信学技報, vol. 104, no. 295, NLP2004-45, pp. 31-36, 2004年9月. |
| 資料番号 |
NLP2004-45 |
| 発行日 |
2004-09-07 (CAS, NLP) |
| ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 |
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