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講演抄録/キーワード
講演名 2007-09-21 14:00
FPGAを用いたオンチップネットワーク型\\確率モデル生化学シミュレータの提案と評価
吉見真聡西川由理小嶋利紀長名保範舟橋 啓慶大)・広井賀子EMBL-EBI)・柴田裕一郎山田英樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大
抄録 (和) (事前公開アブストラクト) 確率モデルによる生化学シミュレーションは離散的な反応系を厳密に取り扱うことができる一方,シミュレーションを膨大な回数繰り返す必要があるため,低コストかつ高速な実行環境が求められている.本研究報告では,確率モデル生化学シミュレーションをFPGA上で実行することを 目的として,ハードウェアモジュールをネットワーク状に接続するフレームワー クを提案し,3種類の回路構造について評価を行った.評価の結果,Xeon 3.20 GHz上での実行と比べ,約4倍のスループットが得られることがわかった.また,性能向上のための検討を行った. 
(英) (Advance abstract in Japanese is available)
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文献情報 信学技報
資料番号  
発行日  
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研究会情報
研究会 RECONF  
開催期間 2007-09-20 - 2007-09-21 
開催地(和) 立命館大学びわこくさつキャンパス (滋賀) 
開催地(英) Ritsumeikan Univ. Biwako Kusatsu Campus (Shiga) 
テーマ(和) リコンフィギャラブルシステム、一般 
テーマ(英) Reconfigurable Systems, etc 
講演論文情報の詳細
申込み研究会 RECONF 
会議コード 2007-09-RECONF 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) FPGAを用いたオンチップネットワーク型\\確率モデル生化学シミュレータの提案と評価 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Proposal and Evaluation of the Network-based Stochastic Biochemical Simulator on an FPGA 
サブタイトル(英)  
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第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 吉見 真聡 / Masato Yoshimi / ヨシミ マサト
第1著者 所属(和/英) 慶應義塾大学 (略称: 慶大)
Keio University (略称: Keio Univ.)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 西川 由理 / Yuri Nishikawa / ニシカワ ユリ
第2著者 所属(和/英) 慶應義塾大学 (略称: 慶大)
Keio University (略称: Keio Univ.)
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) 小嶋 利紀 / Toshinori Kojima / コジマ トシノリ
第3著者 所属(和/英) 慶應義塾大学 (略称: 慶大)
Keio University (略称: Keio Univ.)
第4著者 氏名(和/英/ヨミ) 長名 保範 / Yasunori Osana / オサナ ヤスノリ
第4著者 所属(和/英) 慶應義塾大学 (略称: 慶大)
Keio University (略称: Keio Univ.)
第5著者 氏名(和/英/ヨミ) 舟橋 啓 / Akira Funahashi / フナハシ アキラ
第5著者 所属(和/英) 慶應義塾大学 (略称: 慶大)
Keio University (略称: Keio Univ.)
第6著者 氏名(和/英/ヨミ) 広井 賀子 / Noriko Hiroi / ヒロイ ノリコ
第6著者 所属(和/英) EMBL-EBI, Thornton group Wellcome Trust Genome Campus (略称: EMBL-EBI)
EMBL-EBI, Thornton group Wellcome Trust Genome Campus (略称: EMBL-EBI)
第7著者 氏名(和/英/ヨミ) 柴田 裕一郎 / Yuichiro Shibata / シバタ ユウイチロウ
第7著者 所属(和/英) 長崎大学 (略称: 長崎大)
Nagasaki Univ. (略称: Nagasaki Univ.)
第8著者 氏名(和/英/ヨミ) 山田 英樹 / Hideki Yamada / ヤマダ ヒデキ
第8著者 所属(和/英) 長崎大学 (略称: 長崎大)
Nagasaki Univ. (略称: Nagasaki Univ.)
第9著者 氏名(和/英/ヨミ) 北野 宏明 / Hiroaki Kitano / キタノ ヒロアキ
第9著者 所属(和/英) 科学技術振興機構 (略称: JST)
Japan Science and Technology Agency (略称: JST)
第10著者 氏名(和/英/ヨミ) 天野 英晴 / Hideharu Amano / アマノ ヒデハル
第10著者 所属(和/英) 慶應義塾大学 (略称: 慶大)
Keio University (略称: Keio Univ.)
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講演者 第1著者 
発表日時 2007-09-21 14:00:00 
発表時間 30分 
申込先研究会 RECONF 
資料番号  
巻番号(vol) vol.107 
号番号(no) no.225 
ページ範囲  
ページ数  
発行日  


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