| 講演抄録/キーワード |
| 講演名 |
2008-03-13 16:00
多重検定におけるODP統計量の有効な推定 ○野村啓仁・大羽成征(奈良先端大)・石井 信(京大) NC2007-174 |
| 抄録 |
(和) |
観測条件の違いに応じて発現量の異なる (differentially expressed; DE)遺伝子の検出は,遺伝子発現量の網羅的観測データ解析における重要かつ基本的な課題である。一般に仮説検定の検出精度は統計量の選択に大きく依存するため,様々な統計量が提案されている。近年Storey (2007)が,同時多重仮説検定において最強力であるODP統計量の系統的な導出方法を示し,多重性の高いDE遺伝子検出問題において高性能であることを報告した。しかしこれは推定値に基づいており,現実の問題では推定値を理論的最適値に近づける余地が残っている。
本研究ではODP統計量の推定値の改善手法を開発した。この手法をDE遺伝子検出問題および癌関連外れ値遺伝子検出問題に応用したところ,従来の推定手法よりも優れた検出力が得られた。 |
| (英) |
Detection of differentially expressed (DE) genes between different conditions of sample cells is a basic and fundamental task in gene expression data analyses. Various statistics have been proposed for this task because detection power of hypothesis testing depends on the selection of statistic. Recently, Storey (2007) proposed the optimal discovery procedure (ODP) which provides a systematic process to obtain the most powerful statistic for multiple simultaneous hypothesis testings. Since the original implementation was based on estimation of the ODP, however, large space is left to seek for a better estimation of the ODP from empirical data.
We, in this report, propose an improved estimation of the ODP statistic. We applied it to detection tasks of DE genes and cancer outlier genes, and found that our proposed method achieved the better power than the others including statistics which had been designed specially for cancer outlier genes detection problems. |
| キーワード |
(和) |
遺伝子解析 / 仮説検定 / 多重検定 / 統計量 / ODP / 癌関連外れ値遺伝子 / / |
| (英) |
gene expression analysis / hypothesis testing / multiple simultaneous hypothesis testings / statistic / ODP / cancer outlier genes / / |
| 文献情報 |
信学技報, vol. 107, no. 542, NC2007-174, pp. 367-372, 2008年3月. |
| 資料番号 |
NC2007-174 |
| 発行日 |
2008-03-05 (NC) |
| ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
| PDFダウンロード |
NC2007-174 |
| 研究会情報 |
| 研究会 |
NC MBE |
| 開催期間 |
2008-03-12 - 2008-03-14 |
| 開催地(和) |
玉川大学 |
| 開催地(英) |
Tamagawa Univ |
| テーマ(和) |
一般 |
| テーマ(英) |
|
| 講演論文情報の詳細 |
| 申込み研究会 |
NC |
| 会議コード |
2008-03-NC-MBE |
| 本文の言語 |
日本語 |
| タイトル(和) |
多重検定におけるODP統計量の有効な推定 |
| サブタイトル(和) |
|
| タイトル(英) |
A better estimation of ODP statistic in multiple simultaneous hypotheses testing |
| サブタイトル(英) |
|
| キーワード(1)(和/英) |
遺伝子解析 / gene expression analysis |
| キーワード(2)(和/英) |
仮説検定 / hypothesis testing |
| キーワード(3)(和/英) |
多重検定 / multiple simultaneous hypothesis testings |
| キーワード(4)(和/英) |
統計量 / statistic |
| キーワード(5)(和/英) |
ODP / ODP |
| キーワード(6)(和/英) |
癌関連外れ値遺伝子 / cancer outlier genes |
| キーワード(7)(和/英) |
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| キーワード(8)(和/英) |
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| 第1著者 氏名(和/英/ヨミ) |
野村 啓仁 / Hiroto Nomura / ノムラ ヒロト |
| 第1著者 所属(和/英) |
奈良先端科学技術大学院大学 (略称: 奈良先端大)
NARA Institute of Science and Technology (略称: NAIST) |
| 第2著者 氏名(和/英/ヨミ) |
大羽 成征 / Shigeyuki Oba / オオバ シゲユキ |
| 第2著者 所属(和/英) |
奈良先端科学技術大学院大学 (略称: 奈良先端大)
NARA Institute of Science and Technology (略称: NAIST) |
| 第3著者 氏名(和/英/ヨミ) |
石井 信 / Shin Ishii / |
| 第3著者 所属(和/英) |
京都大学 (略称: 京大)
Kyoto University (略称: Kyoto Univ.) |
| 第4著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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| 講演者 |
第1著者 |
| 発表日時 |
2008-03-13 16:00:00 |
| 発表時間 |
20分 |
| 申込先研究会 |
NC |
| 資料番号 |
NC2007-174 |
| 巻番号(vol) |
vol.107 |
| 号番号(no) |
no.542 |
| ページ範囲 |
pp.367-372 |
| ページ数 |
6 |
| 発行日 |
2008-03-05 (NC) |