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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2009-08-06 13:30 遺伝子発現プロファイルによるネットワーク構造評価 ○齊藤 秀（インフォコム/産総研）・堀本勝久（産総研）  CST2009-12 |
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| 抄録 | （和） | 解析対象のネットワーク構造とその構成分子に関する計測データとが与えられたとき，ネットワーク構造と計測データとの適合度を評価する手法を提案する．シミュレーションにより提案手法が効果的に機能することを示した後，大腸菌SOSネットワークおよび構成遺伝子のプロモーター活性データに適用し，提案手法が計測データに適用可能であることを示す．最後に，多数の既知ネットワーク構造群から特異的条件で計測されたデータに適合するネットワークを同定する，“ネットワークスクリーニング”という概念を提案し，その実行例を示すと共に有用性を議論する． |
| （英） | We propose a novel method to evaluate the goodness-of-fit between the network structure and the data measured for the constituent molecules. We verified the performance of our method for SOS response network in Escherichia coli and the corresponding actual data of prompter activities, in addition to a toy model and the corresponding artificial data. Finally, we develop a concept, named “Network Screening”, which select the network candidates that are consistent with the data measured under a particular condition, from an ensemble of known networks, and furthermore illustrate its validity by an actual example. | |
| キーワード | （和） | ネットワークスクリーニング / 遺伝子発現 / グラフィカルモデル / システムバイオロジー / / / / |
| （英） | Network Screening / Gene Expression / Graphical Model / Systems Biology / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 109, 2009年8月. | |
| 資料番号 | ||
| 発行日 | 2009-07-30 (CST) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | CST2009-12 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS |
| 開催期間 | 2009-08-06 - 2009-08-07 |
| 開催地（和） | JAIST東京キャンパス |
| 開催地（英） | JAIST Tokyo Campus |
| テーマ（和） | システムバイオロジー，一般 |
| テーマ（英） | Systems Biology, etc |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | MSS |
| 会議コード | 2009-08-CST |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | 遺伝子発現プロファイルによるネットワーク構造評価 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Network evaluation from the consistency of the graph structure with gene expression profiles |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | ネットワークスクリーニング / Network Screening |
| キーワード(2)（和/英） | 遺伝子発現 / Gene Expression |
| キーワード(3)（和/英） | グラフィカルモデル / Graphical Model |
| キーワード(4)（和/英） | システムバイオロジー / Systems Biology |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 齊藤 秀 / Shigeru Saito / サイトウ シゲル |
| 第1著者 所属（和/英） | インフォコム株式会社/産業技術総合研究所 (略称： インフォコム/産総研) INFOCOM CORPORATION/National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (略称： INFOCOM/AIST) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 堀本 勝久 / Katsuhisa Horimoto / ホリモト カツヒサ |
| 第2著者 所属（和/英） | 産業技術総合研究所 (略称： 産総研) National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (略称： AIST) |
| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2009-08-06 13:30:00 |
| 発表時間 | 50分 |
| 申込先研究会 | MSS |
| 資料番号 | CST2009-12 |
| 巻番号（vol） | vol.109 |
| 号番号（no） | no.165 |
| ページ範囲 | pp.1-5 |
| ページ数 | 5 |
| 発行日 | 2009-07-30 (CST) |
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