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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2009-08-07 10:20 Analyzing Boolean Networks by Using Integer Programming ○Tatsuya Akutsu・Morihiro Hayashida・Takeyuki Tamura（Kyoto Univ.）  CST2009-17 |
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| 抄録 | （和） | ブーリアンネットワークは遺伝子ネットワークの主要な離散モデルの一つであり，遺伝子ネットワークや他の生物情報ネットワークのモデル化や解析のために数多く利用されてきた．ブーリアンネットワークに関する様々な問題のうち，本稿では点アトラクター検出問題、制御系列計算問題，アトラクター制御問題について考察し，これらを統一的に取り扱うための整数計画法に基づく手法を提案する．さらにこの手法に関する計算機実験結果を示し，提案手法が中規模の問題を解くのに有用であることを示す． |
| （英） | The Boolean network (BN) model is known as a mathematical model of genetic networks and many studies have been done on BNs. In this technical report, we consider the following three problems on BNs: detection of a singleton attractor, finding a control strategy that brings a BN from a given initial state to the desired state, and control of attractors. We propose integer programming-based methods which solve these problems in a unified manner. We also present results of computational experiments, which suggest that the proposed methods are useful for solving moderate size instances of these problems. | |
| キーワード | （和） | 遺伝子ネットワーク / ブーリアンネットワーク / 整数計画法 / アトラクター / / / / |
| （英） | Boolean network / genetic network / integer programming / attractor / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 109, 2009年8月. | |
| 資料番号 | ||
| 発行日 | 2009-07-30 (CST) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | CST2009-17 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS |
| 開催期間 | 2009-08-06 - 2009-08-07 |
| 開催地（和） | JAIST東京キャンパス |
| 開催地（英） | JAIST Tokyo Campus |
| テーマ（和） | システムバイオロジー，一般 |
| テーマ（英） | Systems Biology, etc |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | MSS |
| 会議コード | 2009-08-CST |
| 本文の言語 | 英語 |
| タイトル（和） | |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Analyzing Boolean Networks by Using Integer Programming |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | 遺伝子ネットワーク / Boolean network |
| キーワード(2)（和/英） | ブーリアンネットワーク / genetic network |
| キーワード(3)（和/英） | 整数計画法 / integer programming |
| キーワード(4)（和/英） | アトラクター / attractor |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 阿久津 達也 / Tatsuya Akutsu / アクツ タツヤ |
| 第1著者 所属（和/英） | 京都大学 (略称： 京大) Kyoto University (略称： Kyoto Univ.) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 林田 守広 / Morihiro Hayashida / ハヤシダ モリヒロ |
| 第2著者 所属（和/英） | 京都大学 (略称： 京大) Kyoto University (略称： Kyoto Univ.) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） | 田村 武幸 / Takeyuki Tamura / タムラ タケユキ |
| 第3著者 所属（和/英） | 京都大学 (略称： 京大) Kyoto University (略称： Kyoto Univ.) |
| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2009-08-07 10:20:00 |
| 発表時間 | 50分 |
| 申込先研究会 | MSS |
| 資料番号 | CST2009-17 |
| 巻番号（vol） | vol.109 |
| 号番号（no） | no.165 |
| ページ範囲 | pp.31-36 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2009-07-30 (CST) |
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