講演抄録/キーワード |
講演名 |
2012-07-03 14:20
セルアレイデータに基づくがん細胞分類を支援するタンパク質情報可視化手法の提案 ○北風裕教・井川翔平・伊藤 剛(大島商船高専)・古屋智子(山口大)・神田全啓(大島商船高専)・池田信彦(徳山高専)・松野浩嗣(山口大) CAS2012-23 VLD2012-33 SIP2012-55 MSS2012-23 |
抄録 |
(和) |
レーザースキャニングサイトメータを用いたセルアレイ技術は,細胞内の網羅的なタンパク質分布状況を数値化することで,がん細胞で有意な発現変動を示すタンパク質セットの推定を可能にする.しかし豊富な知識と経験がある病理医師にとっても,これらの数値情報から分類診断を行うことは容易ではない.そこで我々はタンパク質情報を,グラフィック技術を用いることにより分かりやすく可視化することで,この分類診断を支援することを考えた.具体的には,分類基準となるタンパク質の発現範囲や発現量,凝集度の分布の3情報を可視化数列によって表現し,さらにその直感的イメージを提示できるシステムを作成した.この可視化数列には,セルアレイ情報の本質的部分を失うことなく情報圧縮ができるという利点があり,多量なデータの解析の効率化に貢献できる. |
(英) |
Cell array technology using a laser scanning cytometer is to quantify the distribution of intracellular protein, which can allow an estimation of the protein, set to indicate a significant change in expression of cancer cells. However, even for a doctor of pathology to perform such classification of information from these numbers is not easy. So, we can visualize by using easy-to-understand graphics technology, information of protein, thought to support this classification. More specifically, we create a system to visualize these information which are represented by a sequence of three kinds of information cohesion distribution range, the protein expression level and classification criteria. This visualization sequence has the advantage of compression of the data without losing the essential part of the cell array information and also contribute to the efficiency of a large amount of data analysis. |
キーワード |
(和) |
がん細胞 / タンパク質 / 可視化 / レーザースキャニングサイトメーター / 分類 / セルアレイ / / |
(英) |
cancer cell / protein / visualization / laser scanning cytometer / classification / cell array / / |
文献情報 |
信学技報, vol. 112, no. 116, MSS2012-23, pp. 123-128, 2012年7月. |
資料番号 |
MSS2012-23 |
発行日 |
2012-06-25 (CAS, VLD, SIP, MSS) |
ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
PDFダウンロード |
CAS2012-23 VLD2012-33 SIP2012-55 MSS2012-23 |
|