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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2013-03-13 15:35 自己組織化マップを用いたプローブの頻度情報によるDNA配列の解析 ○金子勇太郎・堂薗 浩（佐賀大）  NC2012-150 |
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| 抄録 | （和） | DNAは生物の形態や特徴を決める遺伝情報を含んだゲノムを形成している．DNA塩基配列の大域的な類似性等を解析することによって，生物の多様性や進化系統を探索することが可能である．そこで，本論文ではDNA塩基配列に潜む多様な情報を効率的に抽出することを目的とし，塩基配列の任意の文字数で作成したプローブを用いた自己組織化マップによる解析手法を提案する．プローブで構成されたマップへのDNA塩基配列の写像結果に対して，計算機合成ホログラムを用いてパターン認識を行うことでデータ間の類似性を検討する． |
| （英） | Recently, the next generation sequencers produce the large amount of sequence information of DNA. Thus, it becomes problem to extract the relevant information from whole information. In this study, it is intended to efficiently extract a variety of information hidden in DNA sequence using Self Organizing Maps, which can visualize the multi-dimensional data on the two dimensional plane. The input data of SOM is converted as the probe frequency data to extract the global features of whole sequences. SOM based on the computer generated hologram is used for the clustering of probe maps of DNA sequences. The experiments of classification for the DNA sequence of some species and some metabolic functions are conducted. | |
| キーワード | （和） | 自己組織化マップ / DNA配列解析 / DNAプローブ / 計算機ホログラム / / / / |
| （英） | Self Organizing Map / DNA probe / next generation sequencing / / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 112, no. 480, NC2012-150, pp. 95-100, 2013年3月. | |
| 資料番号 | NC2012-150 | |
| 発行日 | 2013-03-06 (NC) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | NC2012-150 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | MBE NC |
| 開催期間 | 2013-03-13 - 2013-03-15 |
| 開催地（和） | 玉川大学 |
| 開催地（英） | Tamagawa University |
| テーマ（和） | ME，一般 |
| テーマ（英） | |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | NC |
| 会議コード | 2013-03-MBE-NC |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | 自己組織化マップを用いたプローブの頻度情報によるDNA配列の解析 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Analysis of DNA sequences using Self-Organizing Maps based on probe frequences |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | 自己組織化マップ / Self Organizing Map |
| キーワード(2)（和/英） | DNA配列解析 / DNA probe |
| キーワード(3)（和/英） | DNAプローブ / next generation sequencing |
| キーワード(4)（和/英） | 計算機ホログラム / |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 金子 勇太郎 / Yutaro Kaneko / カネコ ユウタロウ |
| 第1著者 所属（和/英） | 佐賀大学大学院 (略称： 佐賀大) Saga University (略称： Saga Univ.) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 堂薗 浩 / Hiroshi Dozono / ドウゾノ ヒロシ |
| 第2著者 所属（和/英） | 佐賀大学大学院 (略称： 佐賀大) Saga University (略称： Saga Univ.) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） | / / |
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| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2013-03-13 15:35:00 |
| 発表時間 | 25分 |
| 申込先研究会 | NC |
| 資料番号 | NC2012-150 |
| 巻番号（vol） | vol.112 |
| 号番号（no） | no.480 |
| ページ範囲 | pp.95-100 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2013-03-06 (NC) |
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