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講演抄録/キーワード
講演名 2014-01-21 10:50
自己組織化マップを用いたDNA配列の視覚化と判別
金子勇太郎堂薗 浩佐賀大NC2013-79
抄録 (和) DNAは生物の形態や特徴を決める遺伝情報を含んだゲノムを形成している.DNA塩基配列の大域的な類似性等を解析することによって,生物の多様性や進化系統を探索することが可能である.最近では次世代シーケンサー技術によって日々膨大な配列データが作りだされ,その大量のデータを解析する効率的な方法が必要ともなっている.そこで,本論文では多次元データの関係性を可視化することができるSOM(自己組織化マップ)を用いて,DNA配列における塩基の出現頻度を入力データとしたマップを作成し解析する手法を使用して,その性能を確認し,評価する方法を検討する. 
(英) Recently, the next generation sequencers produce the large amount of sequence information of DNA. Thus, it becomes problem to extract the relevant information from whole information. In this study, it is intended to efficiently extract a variety of information hidden in DNA sequence using Self Organizing Maps, which can visualize the multi-dimensional data on the two dimensional plane. The experiments of classification for the DNA sequence of some species and some metabolic functions are conducted, and propose the method examine its performance.
キーワード (和) 自己組織化マップ(SOM) / DNA配列解析 / / / / / /  
(英) Self Organizing Map(SOM) / next generation sequencing / / / / / /  
文献情報 信学技報, vol. 113, no. 382, NC2013-79, pp. 73-77, 2014年1月.
資料番号 NC2013-79 
発行日 2014-01-13 (NC) 
ISSN Print edition: ISSN 0913-5685    Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034)
PDFダウンロード NC2013-79

研究会情報
研究会 NC  
開催期間 2014-01-20 - 2014-01-21 
開催地(和) 九州工業大学 若松キャンパス(北九州学術研究都市) 
開催地(英) Kyusyu Institute of Technology 
テーマ(和) ニューロコンピューティングの実装および人間科学のための解析・モデル化,一般 
テーマ(英)  
講演論文情報の詳細
申込み研究会 NC 
会議コード 2014-01-NC 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) 自己組織化マップを用いたDNA配列の視覚化と判別 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Visualization and Discrimination of DNA sequences using Self-Organizing Maps 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) 自己組織化マップ(SOM) / Self Organizing Map(SOM)  
キーワード(2)(和/英) DNA配列解析 / next generation sequencing  
キーワード(3)(和/英) /  
キーワード(4)(和/英) /  
キーワード(5)(和/英) /  
キーワード(6)(和/英) /  
キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 金子 勇太郎 / Yutaro Kaneko / カネコ ユウタロウ
第1著者 所属(和/英) 佐賀大学 (略称: 佐賀大)
Saga University (略称: Saga Univ.)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 堂薗 浩 / Hiroshi Dozono / ドウゾノ ヒロシ
第2著者 所属(和/英) 佐賀大学 (略称: 佐賀大)
Saga University (略称: Saga Univ.)
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講演者 第1著者 
発表日時 2014-01-21 10:50:00 
発表時間 25分 
申込先研究会 NC 
資料番号 NC2013-79 
巻番号(vol) vol.113 
号番号(no) no.382 
ページ範囲 pp.73-77 
ページ数
発行日 2014-01-13 (NC) 


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