| 講演抄録/キーワード |
| 講演名 |
2015-01-30 14:00
複数FPGAボードを用いたビッグデータ分割処理の高速化 ○工藤 龍・須戸里織・オゲ ヤースィン(電通大)・寺田祐太(アバールデータ)・吉見真聡・入江英嗣・吉永 努(電通大) VLD2014-143 CPSY2014-152 RECONF2014-76 |
| 抄録 |
(和) |
インターネットの普及とセンサ技術の発達により,人々が扱うデータはビッグデータと呼ばれるような増大と多様化が進んでいる.ビッグデータの解析には分散システムが使用されるが,その計算時間はデータの配置に大きな影響を受ける.データの分散に要するプロセッサおよびネットワークの負荷は高く,計算機システム全体のパフォーマンスを制約してしまう.そこで我々の研究グループは,データの分散に要する計算と通信をストレージとネットワークを密結合するFPGA上の専用ハードウェアにオフロードする仕組みを提案する.本研究報告ではケーススタディとして,生命科学における配列類似性検索を対象に塩基配列データベースを分散配置するハードウェアを実装し,評価した結果について議論する.est_humanデータベースを対象に評価した結果,ソフトウェアによる同様の処理であるmpiBLASTでのデータ分散と比較して,プロセッサとネットワークの負荷を低く維持したまま,約24から27倍の高速化を確認した. |
| (英) |
Data volume and diversity that we treat have been increasing rapidly because of increasing popularity of the internet and emerging sensor technologies. In order to analyze Big Data, data distribution on multiple computing nodes influences the computational time. Our research group proposes a offloading scheme of such a big data analytics process to a dedicated hardware which equips FPGA, Flash storage and network interface. This technical report describes an implementation of partitioning distribute nucleotide database for sequence similarity search in bioscience as a case study, and discusses the performance evaluation. Through the evaluation of ''est human'' database, we confirm that 24-27 times seep-up is achieved by the proposed method compared to a software-based procedure of mpiBLAST, with maintaining processor and network loads in low. |
| キーワード |
(和) |
FPGA / mpiBLAST / ビッグデータ / パーティショニング / / / / |
| (英) |
FPGA / mpiBLAST / Big Data / Partitioning / / / / |
| 文献情報 |
信学技報, vol. 114, no. 427, CPSY2014-152, pp. 193-198, 2015年1月. |
| 資料番号 |
CPSY2014-152 |
| 発行日 |
2015-01-22 (VLD, CPSY, RECONF) |
| ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
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