講演抄録/キーワード |
講演名 |
2015-08-06 13:30
接頭部和計算に基づく近似文字列探索の並列化 ○三谷康晃・伊野文彦・萩原兼一(阪大) CPSY2015-39 |
抄録 |
(和) |
本論文は,文字列探索の高速化を目的として,探索法の1つであるShift-Or法の並列化手法を提案する.提案手法はShift-Or法を接頭部和計算に帰着することで並列化する.接頭部和計算はワープ内のスレッドが連続領域を参照するように並列処理できるため,GPU(Graphics Processing Unit)上で効率よくShift-Or法を実現できる.本論文では,まず,2種類の2項演算を定義し,これらを用いてShift-Or法の処理を接頭部和計算に帰着するための手順を示す.さらに,接頭部和計算を並列処理するために必要となる各演算の結合性を証明する.評価実験では,セグメント分割に基づく既存手法と提案手法をGPU上で比較した.その結果,完全一致文字列探索に対して,提案手法は既存手法と比較して約1.5倍の高速化を達成した.一方,近似文字列探索に対しては,約76~104%の性能に留まった. |
(英) |
In this paper, aiming at accelerating string search, we propose a parallel method for a shift-or algorithm. Our method achieves parallelization by interpreting the shift-or algorithm as computation of prefix sums. This interpretation allows the shift-or algorithm to run efficiently on a graphics processing unit (GPU), because prefix-sum computation can be parallelized so that threads in a warp can access contiguous memory region. We firstly define two binary operators to realize this interpretation. We then show a proof on the associativity of these operators needed for parallelization of prefix-sum computation. In experiments, we compared our method with a previous method based on data segmentation. As a result, for exact string matching, our method was 1.5 times faster than the previous method. However, for approximate string matching, our method resulted in 76-104% search throughput compared with the previous method. |
キーワード |
(和) |
近似文字列探索 / ビット並列アルゴリズム / 接頭部和 / Shift-Or法 / GPU / / / |
(英) |
approximate string matching / bit parallel algorithm / prefix sums / shift-or algorithm / GPU / / / |
文献情報 |
信学技報, vol. 115, no. 174, CPSY2015-39, pp. 229-234, 2015年8月. |
資料番号 |
CPSY2015-39 |
発行日 |
2015-07-28 (CPSY) |
ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
PDFダウンロード |
CPSY2015-39 |
研究会情報 |
研究会 |
CPSY DC IPSJ-ARC |
開催期間 |
2015-08-04 - 2015-08-06 |
開催地(和) |
ビーコンプラザ(別府) |
開催地(英) |
B-Con Plaza (Beppu) |
テーマ(和) |
並列/分散/協調とディペンダブルコンピューティングおよび一般 |
テーマ(英) |
Parallel, Distributed and Cooperative Processing |
講演論文情報の詳細 |
申込み研究会 |
CPSY |
会議コード |
2015-08-CPSY-DC-ARC |
本文の言語 |
日本語 |
タイトル(和) |
接頭部和計算に基づく近似文字列探索の並列化 |
サブタイトル(和) |
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タイトル(英) |
Parallelization of Approximate String Matching Based on Computation of Prefix Sums |
サブタイトル(英) |
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キーワード(1)(和/英) |
近似文字列探索 / approximate string matching |
キーワード(2)(和/英) |
ビット並列アルゴリズム / bit parallel algorithm |
キーワード(3)(和/英) |
接頭部和 / prefix sums |
キーワード(4)(和/英) |
Shift-Or法 / shift-or algorithm |
キーワード(5)(和/英) |
GPU / GPU |
キーワード(6)(和/英) |
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キーワード(7)(和/英) |
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キーワード(8)(和/英) |
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第1著者 氏名(和/英/ヨミ) |
三谷 康晃 / Yasuaki Mitani / ミタニ ヤスアキ |
第1著者 所属(和/英) |
大阪大学 (略称: 阪大)
Osaka University (略称: Osaka Univ.) |
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) |
伊野 文彦 / Fumihiko Ino / イノ フミヒコ |
第2著者 所属(和/英) |
大阪大学 (略称: 阪大)
Osaka University (略称: Osaka Univ.) |
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) |
萩原 兼一 / Kenichi Hagihara / |
第3著者 所属(和/英) |
大阪大学 (略称: 阪大)
Osaka University (略称: Osaka Univ.) |
第4著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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第10著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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第11著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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第14著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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講演者 |
第1著者 |
発表日時 |
2015-08-06 13:30:00 |
発表時間 |
30分 |
申込先研究会 |
CPSY |
資料番号 |
CPSY2015-39 |
巻番号(vol) |
vol.115 |
号番号(no) |
no.174 |
ページ範囲 |
pp.229-234 |
ページ数 |
6 |
発行日 |
2015-07-28 (CPSY) |