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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2016-03-03 16:15 A Colored Hybrid Petri Net Model for the Delta-Notch Dependent Boundary Formation in the Drosophila Large Intestine ○Fei Liu・Hiroshi Matsuno・Ryutaro Murakami（Yamaguchi Univ.）  MSS2015-76 |
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| 抄録 | （和） | The modeling of the boundary formation in the Drosophila large intestine is a typical mutiscale problem, and it is either time-consuming or hardly addressed by common modeling and simulation tools. As a powerful multiscale modeling and analysis tool for large-scale biological systems, colored hybrid Petri nets can be used to cope with such system. In this paper, we apply colored hybrid Petri nets to model the boundary formation in the large intestine of Drosophila embryo, and build a colored hybrid Petri net model for this biological phenomenon. We validate the model in the wild-type conditions and use the model to make predictions in different over-expression rates of Notch proteins, which well match the experimental observations in vivo. We have shown that colored Petri nets are very appropriate to model such multicellular systems, and our model is scalable and thus we can easily study the model behavior on different size of intestinal tissues. |
| （英） | The modeling of the boundary formation in the Drosophila large intestine is a typical mutiscale problem, and it is either time-consuming or hardly addressed by common modeling and simulation tools. As a powerful multiscale modeling and analysis tool for large-scale biological systems, colored hybrid Petri nets can be used to cope with such system. In this paper, we apply colored hybrid Petri nets to model the boundary formation in the large intestine of Drosophila embryo, and build a colored hybrid Petri net model for this biological phenomenon. We validate the model in the wild-type conditions and use the model to make predictions in different over-expression rates of Notch proteins, which well match the experimental observations in vivo. We have shown that colored Petri nets are very appropriate to model such multicellular systems, and our model is scalable and thus we can easily study the model behavior on different size of intestinal tissues. | |
| キーワード | （和） | colored hybrid Petri nets / Delta-Notch signaling pathway / boundary formation / Drosophila large intestine / / / / |
| （英） | colored hybrid Petri nets / Delta-Notch signaling pathway / boundary formation / Drosophila large intestine / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 115, no. 480, MSS2015-76, pp. 47-52, 2016年3月. | |
| 資料番号 | MSS2015-76 | |
| 発行日 | 2016-02-25 (MSS) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | MSS2015-76 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS |
| 開催期間 | 2016-03-03 - 2016-03-04 |
| 開催地（和） | 海峡メッセ下関 |
| 開催地（英） | KAIKYO MESSE SHIMONOSEKI |
| テーマ（和） | 離散事象システム及び一般、Work In Progress、計測と自動制御学会・離散事象システム部会と併催 |
| テーマ（英） | |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | MSS |
| 会議コード | 2016-03-MSS |
| 本文の言語 | 英語 |
| タイトル（和） | |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A Colored Hybrid Petri Net Model for the Delta-Notch Dependent Boundary Formation in the Drosophila Large Intestine |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | colored hybrid Petri nets / colored hybrid Petri nets |
| キーワード(2)（和/英） | Delta-Notch signaling pathway / Delta-Notch signaling pathway |
| キーワード(3)（和/英） | boundary formation / boundary formation |
| キーワード(4)（和/英） | Drosophila large intestine / Drosophila large intestine |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | Fei Liu / Fei Liu / |
| 第1著者 所属（和/英） | Yamaguchi University (略称： 山口大) Yamaguchi University (略称： Yamaguchi Univ.) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | Hiroshi Matsuno / Hiroshi Matsuno / |
| 第2著者 所属（和/英） | Yamaguchi University (略称： 山口大) Yamaguchi University (略称： Yamaguchi Univ.) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） | Ryutaro Murakami / Ryutaro Murakami / |
| 第3著者 所属（和/英） | Yamaguchi University (略称： 山口大) Yamaguchi University (略称： Yamaguchi Univ.) |
| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2016-03-03 16:15:00 |
| 発表時間 | 25分 |
| 申込先研究会 | MSS |
| 資料番号 | MSS2015-76 |
| 巻番号（vol） | vol.115 |
| 号番号（no） | no.480 |
| ページ範囲 | pp.47-52 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2016-02-25 (MSS) |
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