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講演抄録/キーワード
講演名 2016-05-19 10:45
OpenCLを用いた分子動力学用FPGAアクセラレータの設計
ウィッデヤスーリヤ ハシタ ムトゥマラ張山昌論東北大)・笠原浩太阪大RECONF2016-4
抄録 (和) 分子動力学シミュレーションは原子や分子の性質を学ぶため重要である.しかしながら,シミュレーションには膨大な処理時間がかかる.ハードウェア化により処理時間の削減は可能であるが,そのためハードウェア設計知識,膨大な設計時間とコストがかかる.本研究では,OpenCLというソフトウェア言語によりFPGAアクセラレーターを設計し,その性能評価を述べる.分子動力学シミュレーションで最も時間がかかる非共有結合力の計算時間においては,FPGAアクセラレーターではCPUと比べ4.6倍の高速化が得られている. 
(英) Molecular dynamics (MD) simulations are very important to study physical properties of atoms and molecules. However, a huge amount of processing time is required for the simulation. Although the hardware acceleration provides promising results, hardware design skills, huge design time and financial cost are required to implement an accelerator successfully. In this paper, we propose an FPGA accelerator entirely designed using OpenCL software. We achieved over 4.6 times of speed-up compared to CPU-based processing for the most time consuming non-bonded force calculation in the MD simulation.
キーワード (和) FPGAのためのOpenCL / 分子動力学シミュレーション / ハードウェアアクセラレーター / 科学技術計算 / / / /  
(英) OpenCL for FPGA / molecular dynamics simulation / hardware accelerator / scientific computing / / / /  
文献情報 信学技報, vol. 116, no. 53, RECONF2016-4, pp. 13-16, 2016年5月.
資料番号 RECONF2016-4 
発行日 2016-05-12 (RECONF) 
ISSN Print edition: ISSN 0913-5685    Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034)
PDFダウンロード RECONF2016-4

研究会情報
研究会 RECONF  
開催期間 2016-05-19 - 2016-05-20 
開催地(和) 富士通研究所 
開催地(英) FUJITSU LAB. 
テーマ(和) リコンフィギャラブルシステム、一般 
テーマ(英) Reconfigurable Systems, etc. 
講演論文情報の詳細
申込み研究会 RECONF 
会議コード 2016-05-RECONF 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) OpenCLを用いた分子動力学用FPGAアクセラレータの設計 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Design of an FPGA-based Accelerator for Moleculer Dynamics Using OpenCL 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) FPGAのためのOpenCL / OpenCL for FPGA  
キーワード(2)(和/英) 分子動力学シミュレーション / molecular dynamics simulation  
キーワード(3)(和/英) ハードウェアアクセラレーター / hardware accelerator  
キーワード(4)(和/英) 科学技術計算 / scientific computing  
キーワード(5)(和/英) /  
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キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) ウィッデヤスーリヤ ハシタ ムトゥマラ / Hasitha Muthumala Waidyasooriya / ウィッデヤスーリヤ ハシタ ムトゥマラ
第1著者 所属(和/英) 東北大学 (略称: 東北大)
Tohoku University (略称: Tohoku Univ.)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 張山 昌論 / Masanori Hariyama / ハリヤマ マサノリ
第2著者 所属(和/英) 東北大学 (略称: 東北大)
Tohoku University (略称: Tohoku Univ.)
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) 笠原 浩太 / Kota Kasahara /
第3著者 所属(和/英) 大阪大学 (略称: 阪大)
Osaka University (略称: Osaka Univ.)
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講演者 第1著者 
発表日時 2016-05-19 10:45:00 
発表時間 20分 
申込先研究会 RECONF 
資料番号 RECONF2016-4 
巻番号(vol) vol.116 
号番号(no) no.53 
ページ範囲 pp.13-16 
ページ数
発行日 2016-05-12 (RECONF) 


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