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| 講演名 | 2021-03-25 09:40 メモリデバイスの多様化に伴う使い分け技術の必要性 ～ 分子動力学ソフトウェアGROMACSの動作解析を踏まえた考察 ～ ○児玉宏喜・遠藤浩史・吉川隆英（富士通研）  CPSY2020-50 DC2020-80 |
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| 抄録 | （和） | HBMやOptane™ Persistent Memory（PM）が実用化され始め，スーパーコンピュータにおいては性能の異なる種々のメモリを適切に使いこなす必要性が増している．そのため，アプリケーション毎のメモリ性能要件を把握することが重要になってきている．分子動力学ソフトウエアのGROMACSは，ベンチマーク用途の小規模計算から創薬現場での大規模計算まで幅広く利用されており，一層の高速化が望まれているが，メモリからのデータ供給が性能ボトルネックとなりやすい性質を持つ．本報告では，データ配置最適化による性能向上の可能性を探るため，DRAMをPMのキャッシュとして用いるシステム上で，GROMACSのデータセットサイズをDRAMキャッシュサイズ以下の場合と以上の場合とで性能を比較した．PMでのメモリ拡張なしでは計算できないデータセット（キャッシュサイズの1.4倍）でも，性能低下は15％にとどまっていて，DRAMキャッシュの有効性を確認できた．しかしながら，CPUのサイクルあたりの命令数（IPC）は1より小さく，メモリからのデータ転送待ちの状態であり，データ配置最適化による更なる性能向上の余地が確認できた．この結果から，今後はシステムレベルでのメモリの使い分け技術や階層化技術の研究を進めていく必要があると考えられる． |
| （英） | (Not available yet) | |
| キーワード | （和） | HBM / スーパーコンピュータ / GROMACS / メモリ使い分け技術 / / / / |
| （英） | / / / / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 120, no. 435, CPSY2020-50, pp. 1-6, 2021年3月. | |
| 資料番号 | CPSY2020-50 | |
| 発行日 | 2021-03-18 (CPSY, DC) | |
| ISSN | Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | CPSY2020-50 DC2020-80 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | CPSY DC IPSJ-SLDM IPSJ-EMB IPSJ-ARC |
| 開催期間 | 2021-03-25 - 2021-03-26 |
| 開催地（和） | オンライン開催 |
| 開催地（英） | Online |
| テーマ（和） | 組込み技術とネットワークに関するワークショップ ETNET2021 |
| テーマ（英） | ETNET2021 |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | CPSY |
| 会議コード | 2021-03-CPSY-DC-SLDM-EMB-ARC |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | メモリデバイスの多様化に伴う使い分け技術の必要性 |
| サブタイトル（和） | 分子動力学ソフトウェアGROMACSの動作解析を踏まえた考察 |
| タイトル（英） | The necessity of exploiting various types of memory devices |
| サブタイトル（英） | Discussion based on behavior analysis of molecular dynamics simulation, GROMACS |
| キーワード(1)（和/英） | HBM / |
| キーワード(2)（和/英） | スーパーコンピュータ / |
| キーワード(3)（和/英） | GROMACS / |
| キーワード(4)（和/英） | メモリ使い分け技術 / |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 児玉 宏喜 / Hiroyoshi Kodama / コダマ ヒロヨシ |
| 第1著者 所属（和/英） | 富士通研究所 (略称： 富士通研) Fujitsu Laboratories (略称： F-lab) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 遠藤 浩史 / Hiroshi Endo / エンドウ ヒロシ |
| 第2著者 所属（和/英） | 富士通研究所 (略称： 富士通研) Fujitsu Laboratories (略称： F-lab) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） | 吉川 隆英 / Takahide Yoshikawa / ヨシカワ タカヒデ |
| 第3著者 所属（和/英） | 富士通研究所 (略称： 富士通研) Fujitsu Laboratories (略称： F-lab) |
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| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2021-03-25 09:40:00 |
| 発表時間 | 20分 |
| 申込先研究会 | CPSY |
| 資料番号 | CPSY2020-50, DC2020-80 |
| 巻番号（vol） | vol.120 |
| 号番号（no） | no.435(CPSY), no.436(DC) |
| ページ範囲 | pp.1-6 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2021-03-18 (CPSY, DC) |
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