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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2021-10-23 13:15 ［招待講演］Optimal-Time Queries on BWT-runs Compressed Indexes ○西本崇晃・田部井靖生（理研）  COMP2021-16 |
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| 抄録 | （和） | 共通の部分文字列を多く含む文字列に対して高速なクエリをサポートする索引を構築することは文字列処理分野において重要である．なぜならば，このような索引はバイオインフォマティクスや自然言語処理において多くの応用を持つからである．共通の部分文字列を多く含む文字列に対する索引は，これまでにいくつか提案されているが，さまざまなクエリをサポートする圧縮索引の研究は依然として発展途上である． 連長BWT変換とは可逆データ圧縮の一つであり，共通の部分文字列を多く含む文字列を非常に小さなサイズのデータに変換できる．この圧縮データの構造を利用した圧縮索引の研究が近年活発に行われている． 本講演では，OptBWTRと呼ばれる，連長BWT変換に基づいた圧縮索引を提案する．この索引は$O(r)$ワード領域を使用していくつかのクエリを最適時間で答えることが出来る最初の索引である．ここで，$r$は連長BWT変換したときの連の数である． |
| （英） | Indexing highly repetitive strings (i.e., strings with many repetitions) for fast queries has become a central research topic in string processing, because it has a wide variety of applications in bioinformatics and natural language processing. Although a substantial number of indexes for highly repetitive strings have been proposed thus far, developing compressed indexes that support various queries remains a challenge. The run-length Burrows-Wheeler transform (RLBWT) is a lossless data compression for highly repetitive strings, and it has received interest for indexing highly repetitive strings. In this talk, we present OptBWTR (optimal-time queries on BWT-runs compressed indexes), the first string index that supports various queries in optimal time and $O(r)$ words of space for the number $r$ of runs in RLBWT. |
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| キーワード | （和） | 圧縮索引 / Burrows-Wheeler変換 / 可逆データ圧縮 / / / / / |
| （英） | Compressed text indexes / Burrows-Wheeler transform / Lossless data compression / / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 121, no. 218, COMP2021-16, pp. 19-19, 2021年10月. | |
| 資料番号 | COMP2021-16 | |
| 発行日 | 2021-10-16 (COMP) | |
| ISSN | Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | COMP2021-16 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | COMP |
| 開催期間 | 2021-10-23 - 2021-10-23 |
| 開催地（和） | オンライン開催 |
| 開催地（英） | Online |
| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | COMP |
| 会議コード | 2021-10-COMP |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | Optimal-Time Queries on BWT-runs Compressed Indexes |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Optimal-Time Queries on BWT-runs Compressed Indexes |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | 圧縮索引 / Compressed text indexes |
| キーワード(2)（和/英） | Burrows-Wheeler変換 / Burrows-Wheeler transform |
| キーワード(3)（和/英） | 可逆データ圧縮 / Lossless data compression |
| キーワード(4)（和/英） | / |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 西本 崇晃 / Takaaki Nishimoto / ニシモト タカアキ |
| 第1著者 所属（和/英） | 理化学研究所 (略称： 理研) RIKEN (略称： RIKEN) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 田部井 靖生 / Yasuo Tabei / |
| 第2著者 所属（和/英） | 理化学研究所 (略称： 理研) RIKEN (略称： RIKEN) |
| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2021-10-23 13:15:00 |
| 発表時間 | 60分 |
| 申込先研究会 | COMP |
| 資料番号 | COMP2021-16 |
| 巻番号（vol） | vol.121 |
| 号番号（no） | no.218 |
| ページ範囲 | p.19 |
| ページ数 | 1 |
| 発行日 | 2021-10-16 (COMP) |
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