| 講演抄録/キーワード |
| 講演名 |
2022-01-28 17:30
CNNとスペクトラルクラスタリングを用いたボトムアップ指向の染色体異常識別 ○高見燎世・槇原 靖・八木康史(阪大)・川端絵美・衣笠泰葉・田代 聡(広島大) MVE2021-38 |
| 抄録 |
(和) |
本研究では,染色体の蛍光顕微鏡画像から染色体の要素をボトムアップに検出することで,染色体異常を識別する手法を提案する.染色体は,主にセントロメア・テロメアとそれらを接続するDNAの三つの要素から構成される.まず,畳み込みニューラルネットワーク(Convolutional neural network: CNN)を用いて,セントロメア・テロメアの尤度マップを出力し,そのピークをセントロメア・テロメアの位置とする.また,DNAについては,接続方向の情報を含めた尤度マップをCNNにより出力し,セントロメア・テロメア間を接続するDNAのスコア(信頼度)を計算する.更に,DNAの接続スコアを元に,セントロメア・テロメアの接続を表すグラフの重み付き隣接行列を計算し,スペクトラルクラスタリングにより個別の染色体へ分割する.その際,クラスタリングによる過分割や分割漏れを訂正するため,染色体の形状に基づいた評価関数を定義した上で,再分割や併合処理を適用する.最後に,個々に分割された染色体のグラフ構造を元に,染色体異常を識別する.実験では,21枚の染色体画像を用いて精度評価を行い,結果として,染色体異常識別の精度は90.3%となった. |
| (英) |
(Not available yet) |
| キーワード |
(和) |
染色体 / ボトムアップ手法 / CNN / スペクトラルクラスタリング / 蛍光顕微鏡画像 / / / |
| (英) |
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| 文献情報 |
信学技報, vol. 121, no. 349, MVE2021-38, pp. 49-54, 2022年1月. |
| 資料番号 |
MVE2021-38 |
| 発行日 |
2022-01-20 (MVE) |
| ISSN |
Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
| PDFダウンロード |
MVE2021-38 |
| 研究会情報 |
| 研究会 |
MVE IPSJ-CVIM VRSJ-SIG-MR |
| 開催期間 |
2022-01-27 - 2022-01-28 |
| 開催地(和) |
オンライン開催 |
| 開催地(英) |
Online |
| テーマ(和) |
多様なカメラを用いたメディア処理 |
| テーマ(英) |
|
| 講演論文情報の詳細 |
| 申込み研究会 |
MVE |
| 会議コード |
2022-01-MVE-CVIM |
| 本文の言語 |
日本語(英語タイトルなし) |
| タイトル(和) |
CNNとスペクトラルクラスタリングを用いたボトムアップ指向の染色体異常識別 |
| サブタイトル(和) |
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| タイトル(英) |
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| サブタイトル(英) |
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| キーワード(1)(和/英) |
染色体 / |
| キーワード(2)(和/英) |
ボトムアップ手法 / |
| キーワード(3)(和/英) |
CNN / |
| キーワード(4)(和/英) |
スペクトラルクラスタリング / |
| キーワード(5)(和/英) |
蛍光顕微鏡画像 / |
| キーワード(6)(和/英) |
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| キーワード(7)(和/英) |
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| キーワード(8)(和/英) |
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| 第1著者 氏名(和/英/ヨミ) |
高見 燎世 / Ryosei Takami / タカミ リョウセイ |
| 第1著者 所属(和/英) |
大阪大学 (略称: 阪大)
Osaka University (略称: Osaka Univ.) |
| 第2著者 氏名(和/英/ヨミ) |
槇原 靖 / Yasushi Makihara / マキハラ ヤスシ |
| 第2著者 所属(和/英) |
大阪大学 (略称: 阪大)
Osaka University (略称: Osaka Univ.) |
| 第3著者 氏名(和/英/ヨミ) |
八木 康史 / Yasushi Yagi / ヤギ ヤスシ |
| 第3著者 所属(和/英) |
大阪大学 (略称: 阪大)
Osaka University (略称: Osaka Univ.) |
| 第4著者 氏名(和/英/ヨミ) |
川端 絵美 / Emi Kawabata / カワバタ エミ |
| 第4著者 所属(和/英) |
広島大学 (略称: 広島大)
Hiroshima University (略称: Hiroshima Univ.) |
| 第5著者 氏名(和/英/ヨミ) |
衣笠 泰葉 / yasuha kinugasa / キヌガサ ヤスハ |
| 第5著者 所属(和/英) |
広島大学 (略称: 広島大)
Hiroshima University (略称: Hiroshima Univ.) |
| 第6著者 氏名(和/英/ヨミ) |
田代 聡 / Satoshi Tashiro / タシロ ヤスシ |
| 第6著者 所属(和/英) |
広島大学 (略称: 広島大)
Hiroshima University (略称: Hiroshima Univ.) |
| 第7著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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| 講演者 |
第1著者 |
| 発表日時 |
2022-01-28 17:30:00 |
| 発表時間 |
25分 |
| 申込先研究会 |
MVE |
| 資料番号 |
MVE2021-38 |
| 巻番号(vol) |
vol.121 |
| 号番号(no) |
no.349 |
| ページ範囲 |
pp.49-54 |
| ページ数 |
6 |
| 発行日 |
2022-01-20 (MVE) |