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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2023-03-18 10:05 トピックモデルによる植物根圏細菌叢解析 ○真壁勇那・山村雅幸（東工大）  NLC2022-19 |
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| 抄録 | （和） | 植物において，根圏土壌の細菌叢は根の生育によって変化することが分かっている．本研究ではAvena strigosaにおける根圏効果について，統計的手法（多様性解析，ANCOM）とトピックモデルによる解析を試みた．トピックモデルを用いることで，土壌細菌における細菌の集団としての性質を効果的に表現できると期待された．結果，ANCOMでは植物に影響されていると考えられる細菌群が検出された．一方，トピックモデルによる解析では機能が既知の細菌群は有意に分類されなかったが，土壌中で支配的な細菌属群の割合の違いによってコミュニティが形成されている可能性が示唆された． |
| （英） | The bacterial flora of rhizosphere soils in plants is known to change with root growth. In this study, the rhizosphere effect in Avena strigosa was analyzed using statistical methods (diversity analysis, ANCOM) and topic models. Topic models were expected to effectively represent the collective nature of bacteria in soil bacteria. As a result, ANCOM detected a bacterial population that was considered to be affected by plants. On the other hand, the topic model analysis did not significantly classify bacterial groups with known functions. However, it was suggested that communities may be formed by differences in the proportion of dominant bacterial genera in the soil. | |
| キーワード | （和） | 植物根圏土壌 / メタゲノムデータ / トピックモデル / / / / / |
| （英） | / / / / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 122, no. 449, NLC2022-19, pp. 1-6, 2023年3月. | |
| 資料番号 | NLC2022-19 | |
| 発行日 | 2023-03-11 (NLC) | |
| ISSN | Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | NLC2022-19 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | NLC IPSJ-NL |
| 開催期間 | 2023-03-18 - 2023-03-18 |
| 開催地（和） | 沖縄科学技術大学院大学 |
| 開催地（英） | OIST |
| テーマ（和） | 言語処理の産業・社会応用、および一般 |
| テーマ（英） | Applications of natural language processing, and etc. |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | NLC |
| 会議コード | 2023-03-NLC-NL |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | トピックモデルによる植物根圏細菌叢解析 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Analysis of Bacterial Flora in Plant Rhizosphere by Topic Model |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | 植物根圏土壌 / |
| キーワード(2)（和/英） | メタゲノムデータ / |
| キーワード(3)（和/英） | トピックモデル / |
| キーワード(4)（和/英） | / |
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| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 真壁 勇那 / Isana Makabe / マカベ イサナ |
| 第1著者 所属（和/英） | 東京工業大学 (略称： 東工大) Tokyo Institute of Technology (略称： Tokyo Tech) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 山村 雅幸 / Masayuki Yamamura / ヤマムラ マサユキ |
| 第2著者 所属（和/英） | 東京工業大学 (略称： 東工大) Tokyo Institute of Technology (略称： Tokyo Tech) |
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| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2023-03-18 10:05:00 |
| 発表時間 | 20分 |
| 申込先研究会 | NLC |
| 資料番号 | NLC2022-19 |
| 巻番号（vol） | vol.122 |
| 号番号（no） | no.449 |
| ページ範囲 | pp.1-6 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2023-03-11 (NLC) |
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