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講演抄録/キーワード
講演名 2023-07-07 11:20
Enhancing Glycan Recognition Pattern Learning with Tree-Structured Data Mining
Kento TotsukaNorihiko ShinomiyaKiyoko KinoshitaMasae HosodaSoka Univ.CAS2023-20 VLD2023-20 SIP2023-36 MSS2023-20
抄録 (和) (まだ登録されていません) 
(英) In recent times, the rapid proliferation of semi-structured data has been primarily fueled by the emergence of the World Wide Web and bioinformatics. Notably, tree-structured data has gained prominence as a common format for data storage, and its potential for data mining has garnered significant attention. Glycans, being indispensable biomolecules present in all organisms, are recognized by molecules and play diverse functional roles in the body. They are commonly modeled as tree-structured data and analyzed using machine learning techniques in the domain of glycoinformatics. However, to fully understand the biological properties and functions of glycans, more detailed data is required. To address this research gap, we implemented a novel approach that incorporates information on the binding patterns between monosaccharides, the constituent units of a glycan, into glycan data. The data was subsequently subjected to analysis using the OTMM algorithm, a sophisticated probabilistic model for mining labeled ordered trees. Consequently, this approach enabled the extraction of biologically meaningful structures called motifs in glycans with a high degree of precision and detail, surpassing the results of previous research efforts. This study contributes to a comprehensive understanding of glycan structure recognition mechanisms and their function. The outcome of this study is also expected to enable researchers to conduct experiments on glycans more efficiently and expedite the process of elucidating their essential properties.
キーワード (和) / / / / / / /  
(英) machine learning / probabilistic model / graph theory / glycan / glycoinformatics / bioinformatics / /  
文献情報 信学技報, vol. 123, no. 97, CAS2023-20, pp. 97-101, 2023年7月.
資料番号 CAS2023-20 
発行日 2023-06-29 (CAS, VLD, SIP, MSS) 
ISSN Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034)
PDFダウンロード CAS2023-20 VLD2023-20 SIP2023-36 MSS2023-20

研究会情報
研究会 MSS CAS SIP VLD  
開催期間 2023-07-06 - 2023-07-07 
開催地(和) 小樽商科大学 3号館 102教室 
開催地(英)  
テーマ(和) システムと信号処理および一般 
テーマ(英)  
講演論文情報の詳細
申込み研究会 CAS 
会議コード 2023-07-MSS-CAS-SIP-VLD 
本文の言語 英語 
タイトル(和)  
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Enhancing Glycan Recognition Pattern Learning with Tree-Structured Data Mining 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) / machine learning  
キーワード(2)(和/英) / probabilistic model  
キーワード(3)(和/英) / graph theory  
キーワード(4)(和/英) / glycan  
キーワード(5)(和/英) / glycoinformatics  
キーワード(6)(和/英) / bioinformatics  
キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 戸塚 健人 / Kento Totsuka / トツカ ケント
第1著者 所属(和/英) 創価大学 (略称: 創価大)
Soka University (略称: Soka Univ.)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 篠宮 紀彦 / Norihiko Shinomiya / シノミヤ ノリヒコ
第2著者 所属(和/英) 創価大学 (略称: 創価大)
Soka University (略称: Soka Univ.)
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) 木下 聖子 / Kiyoko Kinoshita / キノシタ キヨコ
第3著者 所属(和/英) 創価大学 (略称: 創価大)
Soka University (略称: Soka Univ.)
第4著者 氏名(和/英/ヨミ) 細田 正恵 / Masae Hosoda / ホソダ マサエ
第4著者 所属(和/英) 創価大学 (略称: 創価大)
Soka University (略称: Soka Univ.)
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講演者 第1著者 
発表日時 2023-07-07 11:20:00 
発表時間 20分 
申込先研究会 CAS 
資料番号 CAS2023-20, VLD2023-20, SIP2023-36, MSS2023-20 
巻番号(vol) vol.123 
号番号(no) no.97(CAS), no.98(VLD), no.99(SIP), no.100(MSS) 
ページ範囲 pp.97-101 
ページ数
発行日 2023-06-29 (CAS, VLD, SIP, MSS) 


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