| 講演抄録/キーワード |
| 講演名 |
2024-03-04 11:10
[ショートペーパー]リンパ節のHE染色画像中の細胞核の集合を入力とする濾胞セグメンテーションとサブタイプ識別 ○森部瑞希・横田達也(名工大)・大島孝一・三好寛明・永石美晴(久留米大)・橋本典明(理研)・竹内一郎(名大)・本谷秀堅(名工大) MI2023-72 |
| 抄録 |
(和) |
本稿では,HE染色画像であるWhole Slide Imageを入力とする濾胞のセグメンテーションと悪性リンパ腫のサブタイプを識別する手法について報告する.濾胞の検出,悪性リンパ腫のサブタイプ識別のいずれも個々の細胞核の形態に加え,各位置近傍や濾胞等の集合に着目している.そのため,ピクセル単位で着目するのではなく,細胞核一つ一つの特徴を捉え,細胞核の集合単位での入力を扱う.これをSet Transformerへの入力とし,集合間の特徴や相互作用を捉え濾胞のセグメンテーションとサブタイプ識別を行う.悪性リンパ腫のサブタイプ識別を行うためには,はじめにWSIから濾胞を検出する必要がある.そのため,濾胞のセグメンテーションがサブタイプ識別にとって重要であり,本研究ではまず濾胞のセグメンテーションを行う.その後,悪性リンパ腫の識別を試みる.本稿では,本手法に基づく濾胞の検出結果と,それに基づく悪性リンパ腫のサブタイプの識別結果について報告する. |
| (英) |
In this paper, we report on a method for follicle segmentation and the identification of malignant lymphoma subtypes using Whole Slide Images (WSIs) stained with Hematoxylin and Eosin (H&E). Our method focuses not only on the morphology of individual cell nuclei but also on the collections of cell nuclei in the vicinity of each location, such as follicles. Therefore, instead of focusing on pixels, we capture the characteristics of each nucleus and process inputs at the level of collections of cell nuclei. These inputs are then used with a Set Transformer to capture the features and interactions between sets, facilitating the segmentation of follicles and the identification of subtypes. To identify the subtypes of malignant lymphoma, it is first necessary to detect follicles in WSIs. Thus, follicular segmentation is crucial for subtype identification, and our research initially focuses on the segmentation of follicles before attempting to identify malignant lymphoma. This paper presents the results of follicle detection based on our method and the identification of malignant lymphoma subtypes derived from it. |
| キーワード |
(和) |
Whole Slide Image / 濾胞セグメンテーション / 悪性リンパ腫 / サブタイプ識別 / SetTransformer / / / |
| (英) |
Whole Slide Image / Follicle Segmentation / Malignant Lymphoma / Subtype Identification / Set Transformer / / / |
| 文献情報 |
信学技報, vol. 123, no. 411, MI2023-72, pp. 131-132, 2024年3月. |
| 資料番号 |
MI2023-72 |
| 発行日 |
2024-02-25 (MI) |
| ISSN |
Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
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MI2023-72 |