| 講演抄録／キーワード |
| 講演名 |
2006-06-15 13:50
ネットワーク型雑音除去によるマイクロアレイデータからの薬剤耐性予測
○加藤 毅（東大）・三浦 康・村田幸生（東北大）・浅井 潔（東大）・ポール ホートン・藤渕 航・津田宏治（産総研） |
| 抄録 |
（和） |
マイクロアレイデータから抗がん剤の耐性を予測するのは難しいタスクである．その理由のひとつにマイクロアレイデータが多くの雑音を含んでいること
があげられる．本論文ではオフ部分空間雑音除去法を拡張して配列相同性やたんぱく質相互作用などから得られる非一様なネットワークデータを利用して
雑音を除去する方法を提案する．実験により，薬剤耐性予測にこの雑音除去法を組み合わせると，予測性能が向上することを示す． |
| （英） |
Prediction of human cell response to anti-cancer drugs (compounds) from microarray data is a challenging problem, due to the noise properties of microarrays as well as the high variance of living cell responses to drugs. Hence there is a strong need for more practical and robust methods than standard methods for real-value prediction. We devised an extended version of the off-subspace noise-reduction (de-noising) method to incorporate heterogeneous network data such as sequence similarity or protein protein interactions into a single framework. Experimental results show that prediction performance is improved by combining a prediction method with our de-noising method. |
| キーワード |
（和） |
マイクロアレイデータ / 抗がん剤 / ネットワーク / オフ部分空間雑音除去法 / / / / |
| （英） |
microarray data / anti-cancer drugs / network / off-subspace de-noising method / / / / |
| 文献情報 |
信学技報, vol. 106, no. 101, NC2006-16, pp. 43-48, 2006年6月. |
| 資料番号 |
NC2006-16 |
| 発行日 |
2006-06-08 (NC) |
| ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 |
| PDFダウンロード |
|
| 研究会情報 |
| 研究会 |
NC |
| 開催期間 |
2006-06-15 - 2006-06-16 |
| 開催地（和） |
OIST |
| 開催地（英） |
OIST |
| テーマ（和） |
「機械学習によるバイオデータマインニング」および「一般」 |
| テーマ（英） |
Bio-data Mining with Machine Learning and General |
| 講演論文情報の詳細 |
| 申込み研究会 |
NC |
| 会議コード |
2006-06-NC |
| 本文の言語 |
英語（日本語タイトルあり） |
| タイトル（和） |
ネットワーク型雑音除去によるマイクロアレイデータからの薬剤耐性予測 |
| サブタイトル（和） |
|
| タイトル（英） |
Drug-response prediction from microarray data using network-based de-noising |
| サブタイトル（英） |
|
| キーワード(1)（和/英） |
マイクロアレイデータ / microarray data |
| キーワード(2)（和/英） |
抗がん剤 / anti-cancer drugs |
| キーワード(3)（和/英） |
ネットワーク / network |
| キーワード(4)（和/英） |
オフ部分空間雑音除去法 / off-subspace de-noising method |
| キーワード(5)（和/英） |
/ |
| キーワード(6)（和/英） |
/ |
| キーワード(7)（和/英） |
/ |
| キーワード(8)（和/英） |
/ |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） |
加藤 毅 / Tsuyoshi Kato / カトウ ツヨシ |
| 第1著者 所属（和/英） |
東京大学 (略称： 東大)
University of Tokyo (略称： Univ. of Tokyo) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） |
三浦 康 / Koh Miura / ミウラ コウ |
| 第2著者 所属（和/英） |
東北大学 (略称： 東北大)
Tohoku University (略称： Tohoku Univ.) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） |
村田 幸生 / Yukio Murata / ムラタ ユキオ |
| 第3著者 所属（和/英） |
東北大学 (略称： 東北大)
Tohoku University (略称： Tohoku Univ.) |
| 第4著者 氏名（和/英/ヨミ） |
浅井 潔 / Kiyoshi Asai / アサイ キヨシ |
| 第4著者 所属（和/英） |
東京大学 (略称： 東大)
University of Tokyo (略称： Univ. of Tokyo) |
| 第5著者 氏名（和/英/ヨミ） |
ポール ホートン / Paul B. Horton / ポール ホートン |
| 第5著者 所属（和/英） |
産業技術総合研究所 (略称： 産総研)
AIST (略称： AIST) |
| 第6著者 氏名（和/英/ヨミ） |
藤渕 航 / Wataru Fujibuchi / フジブチ ワタル |
| 第6著者 所属（和/英） |
産業技術総合研究所 (略称： 産総研)
AIST (略称： AIST) |
| 第7著者 氏名（和/英/ヨミ） |
津田 宏治 / Koji Tsuda / ツダ コウジ |
| 第7著者 所属（和/英） |
産業技術総合研究所 (略称： 産総研)
AIST (略称： AIST) |
| 第8著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第8著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第9著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第9著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第10著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第10著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第11著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第11著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第12著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第12著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第13著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第13著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第14著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第14著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第15著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第15著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第16著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第16著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第17著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第17著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第18著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第18著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第19著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第19著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第20著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第20著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第21著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第21著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第22著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第22著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第23著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第23著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第24著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第24著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第25著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第25著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第26著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第26著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第27著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第27著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第28著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第28著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第29著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第29著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第30著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第30著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第31著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第31著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第32著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第32著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第33著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第33著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第34著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第34著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第35著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第35著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 第36著者 氏名（和/英/ヨミ） |
/ / |
| 第36著者 所属（和/英） |
(略称： )
(略称： ) |
| 講演者 |
第1著者 |
| 発表日時 |
2006-06-15 13:50:00 |
| 発表時間 |
20分 |
| 申込先研究会 |
NC |
| 資料番号 |
NC2006-16 |
| 巻番号（vol） |
vol.106 |
| 号番号（no） |
no.101 |
| ページ範囲 |
pp.43-48 |
| ページ数 |
6 |
| 発行日 |
2006-06-08 (NC) |