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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2009-05-25 15:00 最近傍多変量検定を用いたアレイCGHのゲノム異常領域同定に関する一考察 ○石川勇太・竹内一郎（名工大）  NC2009-6 |
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| 抄録 | （和） | 近年，ゲノムのコピー数異常を網羅的に検出するための技術としてArray CGHと呼ばれる技術が開発され注目されている． Array CGHにより検出されたコピー数異常を用いることで，疾患の原因となっている異常を領域的に同定することが可能になる． しかし，異常領域を同定するには次元の異なるデータの統計量を比較する必要があり，更にそれらを全ての可能なゲノム領域について行なわなければならない． 従って，検定の多重性やそれらの相関，更に適切な統計量を用いるなどの対処が不可欠となる． 本研究では，最近傍多変量検定を用いることで，これらの問題に対処する． また，最近傍多変量検定により計算コストも低く抑えることができることを示す． |
| （英） | Array CGH is a useful technology for exhaustively detecting the copy number aberration of the entire genome. In this paper, we are concerned with the problem of identifying aberration regions that has different copy number alteration properties between two samples. We propose to use nearest neighbor multivariate test for this purpose. We discuss the advantage of this approach and demonstrate the effectiveness through an application to previously published malignant array CGH data set on 75 patients. |
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| キーワード | （和） | アレイCGH / 多変量検定 / 多重比較 / 並び替え検定 / 最近傍法 / / / |
| （英） | array CGH / multivariate test / multiple-compare / permutation test / nearest neighbor / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 109, no. 53, NC2009-6, pp. 31-36, 2009年5月. | |
| 資料番号 | NC2009-6 | |
| 発行日 | 2009-05-18 (NC) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | NC2009-6 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
| 開催期間 | 2009-05-25 - 2009-05-26 |
| 開催地（和） | 沖縄科学技術研究基盤整備機構(OIST) |
| 開催地（英） | OIST, Okinawa |
| テーマ（和） | 機械学習によるバイオデータマインニング、一般 |
| テーマ（英） | Machine Learning Approach to Biodata Mining in Biological Phenomena, and General |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | NC |
| 会議コード | 2009-05-NC |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | 最近傍多変量検定を用いたアレイCGHのゲノム異常領域同定に関する一考察 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A Study on Aberration Region Detection for Array CGH Using Nearest Neighbor Multivariate Test |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | アレイCGH / array CGH |
| キーワード(2)（和/英） | 多変量検定 / multivariate test |
| キーワード(3)（和/英） | 多重比較 / multiple-compare |
| キーワード(4)（和/英） | 並び替え検定 / permutation test |
| キーワード(5)（和/英） | 最近傍法 / nearest neighbor |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 石川 勇太 / Yuta Ishikawa / イシカワ ユウタ |
| 第1著者 所属（和/英） | 名古屋工業大学 (略称： 名工大) Nagoya Institute of Technology (略称： Nagoya Inst. of Tech.) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 竹内 一郎 / Ichiro Takeuchi / タケウチ イチロウ |
| 第2著者 所属（和/英） | 名古屋工業大学 (略称： 名工大) Nagoya Institute of Technology (略称： Nagoya Inst. of Tech.) |
| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2009-05-25 15:00:00 |
| 発表時間 | 30分 |
| 申込先研究会 | NC |
| 資料番号 | NC2009-6 |
| 巻番号（vol） | vol.109 |
| 号番号（no） | no.53 |
| ページ範囲 | pp.31-36 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2009-05-18 (NC) |
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