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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2010-03-10 10:40 サポートベクトルマシンのラベル並べ替え解のパス追跡とマイクロアレイデータ解析への応用に関する一考察 ○石川勇太・磯部浩太・竹内一郎（名工大）  NC2009-132 |
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| 抄録 | （和） | マイクロアレイ技術により多くの遺伝子発現量を同時に計測できるようになった. マイクロアレイデータ解析の基本的なタスクは, 健常者とがん患者などの二群において発現量の異なる遺伝子を同定することである. 本研究では個々の遺伝子を対象とするのでなく, 生物学的に関連の深い複数の遺伝子から成るグループ(遺伝子グループ) のうち, 二群で発現パターンの異なっているものを同定する問題を考察する. このような遺伝子グループを同定する問題は遺伝子グループ解析(gene set analysis) と呼ばれ, 多変量二標本検定として定式化される. 本研究ではこの問題のためにサポートベクトルマシン(SVM) の分類誤差を統計量とする多変量二標本検定を導入する. このアプローチにおいては, 統計量の帰無分布をラベル並べ替え演算により推定するため, SVM の学習(最適化) を多数回行わなくてはならない. 本稿では, 並べ替えられたラベルに対するSVM の最適解を効率的に計算するための方法論としてパス追跡を用いたアルゴリズムを提案する. |
| （英） | Microarray technology enables us to measure expression levels of thousands of genes simultaneously.The fundamental task of microarray data analysis is to find differentially expressed genes between two samples. In this study we consider how to find differentially expressed gene sets rather than individual genes) between two samples. This task is called gene set analysis and it is mathematically formulated as multivariate two-sample test. As an approach of gene set analysis, we introduce a multivariate two-sample test whose test statistic is given by the classification error of support vector machine (SVM) classifier. The null distribution of the statistic is computed based on label permutation operation, and thus we need to train many SVM classifiers for permuted labels. In this paper we are concerned with the problem of reducing the computational cost of this operation by proposing a path-following algorithm to compute the path of label-permuted SVM classifiers. |
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| キーワード | （和） | サポートベクトルマシン / パス追跡 / ラベル並べ替え検定 / マイクロアレイ / GSEA / / / |
| （英） | Support Vector Machine / Path Following / Label-Permutation / Microarray / GSEA / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 109, no. 461, NC2009-132, pp. 261-266, 2010年3月. | |
| 資料番号 | NC2009-132 | |
| 発行日 | 2010-03-02 (NC) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | NC2009-132 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC MBE |
| 開催期間 | 2010-03-09 - 2010-03-11 |
| 開催地（和） | 玉川大学 |
| 開催地（英） | Tamagawa University |
| テーマ（和） | 一般 |
| テーマ（英） | General |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | NC |
| 会議コード | 2010-03-NC-MBE |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | サポートベクトルマシンのラベル並べ替え解のパス追跡とマイクロアレイデータ解析への応用に関する一考察 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A Study on Path Following of Label-Permuted Solution for Support Vector Machine and its Application for Microarray Data Analysis |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | サポートベクトルマシン / Support Vector Machine |
| キーワード(2)（和/英） | パス追跡 / Path Following |
| キーワード(3)（和/英） | ラベル並べ替え検定 / Label-Permutation |
| キーワード(4)（和/英） | マイクロアレイ / Microarray |
| キーワード(5)（和/英） | GSEA / GSEA |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 石川 勇太 / Yuta Ishikawa / イシカワ ユウタ |
| 第1著者 所属（和/英） | 名古屋工業大学 (略称： 名工大) Nagoya Institute of Technology (略称： Nagoya Inst. of Tech.) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 磯部 浩太 / Kouta Isobe / イソベ コウタ |
| 第2著者 所属（和/英） | 名古屋工業大学 (略称： 名工大) Nagoya Institute of Technology (略称： Nagoya Inst. of Tech.) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） | 竹内 一郎 / Ichiro Takeuchi / タケウチ イチロウ |
| 第3著者 所属（和/英） | 名古屋工業大学 (略称： 名工大) Nagoya Institute of Technology (略称： Nagoya Inst. of Tech.) |
| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2010-03-10 10:40:00 |
| 発表時間 | 25分 |
| 申込先研究会 | NC |
| 資料番号 | NC2009-132 |
| 巻番号（vol） | vol.109 |
| 号番号（no） | no.461 |
| ページ範囲 | pp.261-266 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2010-03-02 (NC) |
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