| 講演抄録/キーワード |
| 講演名 |
2024-03-13 15:25
機械学習によるタンパク質の可溶性予測とメタヒューリスティクスによる複数変異パターンの探索 ○小島海聖・榊原一紀・中村正樹(富山県立大)・松井大亮(立命館大) MSS2023-80 NLP2023-132 |
| 抄録 |
(和) |
産業に利用することのできない不溶性タンパク質を可溶化させるため,タンパク質の一部を変異させ可溶化させる実験が行われている.しかし,候補となる変異の組み合わせが膨大なため,アミノ酸配列情報から可溶性を予測する機械学習モデルを用いながら複数の変異をメタヒューリスティクスで探索することで,可溶性の向上する変異パターンを効率よく発見する方法を検討する. |
| (英) |
In order to solubilize insoluble proteins that cannot be used for industrial purposes, experiments have been performed to mutate a part of the protein to make it soluble. However, the number of possible mutation combinations is large, and we investigate an efficient method to find mutation patterns that improve solubility by using machine learning models to predict solubility based on amino acid sequence information, and by searching multiple mutations using meta-heuristics. |
| キーワード |
(和) |
タンパク質 / 可溶性度合 / 機械学習 / メタヒューリスティクス / 擬似焼きなまし法 / / / |
| (英) |
protein / solubility / machine learning / meta-heuristics / simulated annealing / / / |
| 文献情報 |
信学技報, vol. 123, no. 427, MSS2023-80, pp. 48-53, 2024年3月. |
| 資料番号 |
MSS2023-80 |
| 発行日 |
2024-03-06 (MSS, NLP) |
| ISSN |
Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
| PDFダウンロード |
MSS2023-80 NLP2023-132 |
| 研究会情報 |
| 研究会 |
NLP MSS |
| 開催期間 |
2024-03-13 - 2024-03-14 |
| 開催地(和) |
機械振興会館 |
| 開催地(英) |
Kikai-Shinko-Kaikan Bldg. |
| テーマ(和) |
MSS,NLP,一般,およびWIP(MSSのみ) |
| テーマ(英) |
MSS, NLP, etc. |
| 講演論文情報の詳細 |
| 申込み研究会 |
MSS |
| 会議コード |
2024-03-NLP-MSS |
| 本文の言語 |
日本語 |
| タイトル(和) |
機械学習によるタンパク質の可溶性予測とメタヒューリスティクスによる複数変異パターンの探索 |
| サブタイトル(和) |
|
| タイトル(英) |
Machine learning-based solubility prediction and meta-heuristic search for multiple mutation patterns |
| サブタイトル(英) |
|
| キーワード(1)(和/英) |
タンパク質 / protein |
| キーワード(2)(和/英) |
可溶性度合 / solubility |
| キーワード(3)(和/英) |
機械学習 / machine learning |
| キーワード(4)(和/英) |
メタヒューリスティクス / meta-heuristics |
| キーワード(5)(和/英) |
擬似焼きなまし法 / simulated annealing |
| キーワード(6)(和/英) |
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| キーワード(7)(和/英) |
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| キーワード(8)(和/英) |
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| 第1著者 氏名(和/英/ヨミ) |
小島 海聖 / Kaisei Kojima / コジマ カイセイ |
| 第1著者 所属(和/英) |
富山県立大学 (略称: 富山県立大)
Toyama Prefectural University (略称: Toyama Prefectural Univ.) |
| 第2著者 氏名(和/英/ヨミ) |
榊原 一紀 / Kazutoshi Sakakibara / サカキバラ カズトシ |
| 第2著者 所属(和/英) |
富山県立大学 (略称: 富山県立大)
Toyama Prefectural University (略称: Toyama Prefectural Univ.) |
| 第3著者 氏名(和/英/ヨミ) |
中村 正樹 / Masaki Nakamura / ナカムラ マサキ |
| 第3著者 所属(和/英) |
富山県立大学 (略称: 富山県立大)
Toyama Prefectural University (略称: Toyama Prefectural Univ.) |
| 第4著者 氏名(和/英/ヨミ) |
松井 大亮 / Daisuke Matsui / マツイ ダイスケ |
| 第4著者 所属(和/英) |
立命館大学 (略称: 立命館大)
Ritsumeikan University (略称: Ritsumeikan Univ.) |
| 第5著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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| 講演者 |
第1著者 |
| 発表日時 |
2024-03-13 15:25:00 |
| 発表時間 |
25分 |
| 申込先研究会 |
MSS |
| 資料番号 |
MSS2023-80, NLP2023-132 |
| 巻番号(vol) |
vol.123 |
| 号番号(no) |
no.427(MSS), no.428(NLP) |
| ページ範囲 |
pp.48-53 |
| ページ数 |
6 |
| 発行日 |
2024-03-06 (MSS, NLP) |
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