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講演抄録/キーワード
講演名 2024-03-13 15:25
機械学習によるタンパク質の可溶性予測とメタヒューリスティクスによる複数変異パターンの探索
小島海聖榊原一紀中村正樹富山県立大)・松井大亮立命館大MSS2023-80 NLP2023-132
抄録 (和) 産業に利用することのできない不溶性タンパク質を可溶化させるため,タンパク質の一部を変異させ可溶化させる実験が行われている.しかし,候補となる変異の組み合わせが膨大なため,アミノ酸配列情報から可溶性を予測する機械学習モデルを用いながら複数の変異をメタヒューリスティクスで探索することで,可溶性の向上する変異パターンを効率よく発見する方法を検討する. 
(英) In order to solubilize insoluble proteins that cannot be used for industrial purposes, experiments have been performed to mutate a part of the protein to make it soluble. However, the number of possible mutation combinations is large, and we investigate an efficient method to find mutation patterns that improve solubility by using machine learning models to predict solubility based on amino acid sequence information, and by searching multiple mutations using meta-heuristics.
キーワード (和) タンパク質 / 可溶性度合 / 機械学習 / メタヒューリスティクス / 擬似焼きなまし法 / / /  
(英) protein / solubility / machine learning / meta-heuristics / simulated annealing / / /  
文献情報 信学技報, vol. 123, no. 427, MSS2023-80, pp. 48-53, 2024年3月.
資料番号 MSS2023-80 
発行日 2024-03-06 (MSS, NLP) 
ISSN Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034)
PDFダウンロード MSS2023-80 NLP2023-132

研究会情報
研究会 NLP MSS  
開催期間 2024-03-13 - 2024-03-14 
開催地(和) 機械振興会館 
開催地(英) Kikai-Shinko-Kaikan Bldg. 
テーマ(和) MSS,NLP,一般,およびWIP(MSSのみ) 
テーマ(英) MSS, NLP, etc. 
講演論文情報の詳細
申込み研究会 MSS 
会議コード 2024-03-NLP-MSS 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) 機械学習によるタンパク質の可溶性予測とメタヒューリスティクスによる複数変異パターンの探索 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Machine learning-based solubility prediction and meta-heuristic search for multiple mutation patterns 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) タンパク質 / protein  
キーワード(2)(和/英) 可溶性度合 / solubility  
キーワード(3)(和/英) 機械学習 / machine learning  
キーワード(4)(和/英) メタヒューリスティクス / meta-heuristics  
キーワード(5)(和/英) 擬似焼きなまし法 / simulated annealing  
キーワード(6)(和/英) /  
キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 小島 海聖 / Kaisei Kojima / コジマ カイセイ
第1著者 所属(和/英) 富山県立大学 (略称: 富山県立大)
Toyama Prefectural University (略称: Toyama Prefectural Univ.)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 榊原 一紀 / Kazutoshi Sakakibara / サカキバラ カズトシ
第2著者 所属(和/英) 富山県立大学 (略称: 富山県立大)
Toyama Prefectural University (略称: Toyama Prefectural Univ.)
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) 中村 正樹 / Masaki Nakamura / ナカムラ マサキ
第3著者 所属(和/英) 富山県立大学 (略称: 富山県立大)
Toyama Prefectural University (略称: Toyama Prefectural Univ.)
第4著者 氏名(和/英/ヨミ) 松井 大亮 / Daisuke Matsui / マツイ ダイスケ
第4著者 所属(和/英) 立命館大学 (略称: 立命館大)
Ritsumeikan University (略称: Ritsumeikan Univ.)
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講演者 第1著者 
発表日時 2024-03-13 15:25:00 
発表時間 25分 
申込先研究会 MSS 
資料番号 MSS2023-80, NLP2023-132 
巻番号(vol) vol.123 
号番号(no) no.427(MSS), no.428(NLP) 
ページ範囲 pp.48-53 
ページ数
発行日 2024-03-06 (MSS, NLP) 


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